อิชิกาว่า โกเอมอน จอมโจรที่ปล้นของจากคนชั่วร่ำรวยเพื่อมาให้คนยากจน มีวีรกรรมผาดโผนราวกับฮีโร่ล้ำยุค นินจา จอมโจรชื่อดัง “โกเอมอน อิชิกาว่า” มีชีวิตโลดแล่นในยุคเซงโงกุ เป็นช่วงเวลาที่ประเทศมีการสู้รบ โกเอมอน เปรียบประหนึ่งฮีโร่ของประชาชนในยุคนั้น ด้วยวีรกรรมที่มักปล้นสมบัติเงินทางจากคนชั่วที่ร่ำรวยมาช่วยเหลือคนยากจน แต่แล้วคืนหนึ่ง โกเอมอน ขโมย กล่องนำเข้าจากตะวันตกใบหนึ่งจากขุมคลังสมบัติของพ่อค้ามหาเศรษฐี โกเอมอน พบว่า ความลับที่ซ่อนอยู่ในกล่องนั้น ไม่เพียงจะเปลี่ยนแปลงชีวิตเขาเอง แต่ยังเปลี่ยนแปลงประวัติศาสตร์ได้ เพราะภายในกล่องซ่อนความลับเกี่ยวกับการลอบสังหาร “โนบุนางะ” ผู้นำที่มีบทบาทในการรวมญี่ปุ่นเป็นปึกแผ่น ความลับนี้อาจจะเปลี่ยนขั้วอำนาจปกครองและความอิสรภาพของผู้คนทั้งแผ่นดิน ความลับที่โกเอมอนค้นพบ นำไปสู่ความผันแปรชีวิตเขา ไม่ว่าจะ ความสัมพันธ์กับ “ไซโซ คิริกากูเระ” เพื่อนสนิทวัยเด็กของโกเอมอน หรือ แม้แต่ ความรักของเขาต่อหญิงสาว ชาช่า แต่ก็ไม่อาจต้านความเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้น ดังเช่นที่เคยเกิดกับนักสู้คนอื่น ๆ ในประวัติศาสตร์ ฮิเดโยชิ โตโยโตมิ, มิสุนาริ อิชิดะ และ ซาสุเกะ วารุโตบิ นักรบเหล่านี้ต่างต่อสู้เพื่อความเชื่อที่แตกต่างกัน นำมาซึ่งความแตกแยก บัดนี้ ถึงเวลาที่ โกเอมอน ต้องตัดสินใจตามความเชื่อของตน